陈文哲（党委书记、主任）

主持中心党委和行政全面工作。负责党建和党风廉政建设、宣传、意识形态、精神文明建设、人事、机构编制、工资社保、职称教育、财务、内部审计、部门预算、资产管理、政府采购、规划计划、水运项目建设等工作。主管党委办公室、人事科、财务审计科。

黎颖（纪委书记）

主管纪检监察工作，协助负责中心党委日常工作，以及党建和党风廉政建设、巡视巡察、宣传、意识形态、精神文明建设、人事、机构编制、工资社保、职称教育、乡村振兴、共青团等工作。分管监察室、协助分管党委办公室、人事科。

庞学毅（副主任）

负责航道航标养护管理、船闸运行协调、基础设施建设，航道行政许可技术初审、协调与河湖长制和航道行政执法相关的工作，协助负责规划计划，水运项目建设等工作。分管航道管理科、航标管理科。

罗金先（副主任）

负责政策法规、机要保密、公文处理、政务公开、政务信息、绩效管理、信访、行政后勤、科研技术、信息化建设、环境保护、节能减排等工作。分管办公室、科技信息管理科。

谷攀亮（副主任）

负责设施设备管理、安全应急、防汛防疫、综治维稳、工会和离退休人员服务管理工作。协助负责财务、内部审计、部门预算、资产管理、政府采购等工作。分管设备管理科（增挂安全管理科）、离退休人员工作科，协助分管财务审计科。